杨峥如今在官场也不算是菜鸟了，对于内阁与吏部的那点猫腻还是知道的些，从洪武起，用哪明代的内阁大学士毕竟无宰相之名。按照明朝制度规定“六部分莅天下事，内阁不得侵”。六部尚书直接向皇帝负责，而绝不是内阁的属官。内阁与六部没有任何的隶属关系，内阁大学士兼尚书只是虚衔，不许实际掌管六部的事务。正如清人纪昀所说“汉以来，六曹皆宰相之统属也。然自明革中书省，析其事权归之六部，始得专达于天子，而内阁惟司票拟之职，与古制迥异也。”可见内阁并无对部臣发号施令之权，更无直接任免官吏的权限。朱元璋规定以部院“分理天下庶务，彼此颉颃，不敢相压，事皆朝廷总之，所以稳当”，这成了部院行政独立的法宝。然而，随着内阁权势的不断扩张，内阁对部院之权不断侵夺。永乐时，内阁初设，“阁臣与部臣为平交，至严嵩始阴挠部权，迨张居正时，部权尽归内阁。“甚至出现“各部之事，皆听命于阁下，所不待言，虽选曹有员缺也送揭与阁，然后注选”的局面。对张居正的任何决策，六部尚书只能随声附和，而不敢有异议。“六卿伺色探旨，若六曹吏称次者，亦惕息屏气，而不敢有所异同，于是乎相之形张矣。”这样，内阁与部院已不处于同一的权力层次，阁权已凌驾于部权之上。而吏部自问天官，掌管天下文官的任免、考课、升降、勋封、调动等事务，不能因为内阁的存在，而降低了身份，如此一来双方你来我往，彼此没什么好感。
这一点从宣德后越发明显，如万历年间，内阁权势最显赫之时，东林党人顾宪成、钱一本等人纷纷上疏指责阁臣侵犯部院之权。顾宪成说“祖罢中书省而设六部，惟恐其权不散，严嵩以来，内阁合六部而揽之，惟恐其权不聚。散则互钤，权臣不得行其乱，国家之利也，聚则独制，各人不得守其职，权臣之利也。”钱一本上疏道“部院即分职六卿，内阁即论道三公，未闻三公可尽揽六卿之权归一人掌握，而六卿又頫首屏气，唯唯听命于三公，必为请教而后行也。”不少部院之官还援引明朝祖制，上疏道“阁臣衔列翰林，止备顾问，从容论思而已，张居正专擅政事，胁制朝臣，祖宗之法若是乎”？言官史孟麟在厉声指责“阁臣侵部院之权”的同时，要求内阁“与天下更始，政事归六部，公论付言官。”双方的争斗一直就听过，但吏部位置虽好，但终究是胳膊拧不过大腿，从内阁成有了票拟的权力后，经过无早已凌驾吏部，到明朝后期，内阁与吏部，已是，外论必以为非；内阁所非，外论必以为是”的政治格局。