一望无垠的荒野之上，一个年轻的男子缓步前行，他的五官并不是非常的精致帅气，只能算是小帅，但他的身上却拥有一种独特的气质，让他看上去充满了无穷的吸引力，而他的身后跟着一只通体紫色，长着四条腿，跟小龙虾长得有点像的怪物。
长得跟小龙虾有点像的怪物叫盖洛斯，是元星的生物长期呆在“紫雾区”发生变异形成，而紫雾区是圣柜产生的辐射带，圣柜则是元星少数人类对坠落在地表的宇宙飞船内一种神秘装置的称呼。
盖洛斯前面的那个男子，正是已经来到这个世界两天的叶云，两天之前，外出跟同学逛街的林盈盈在吃完饭洗完澡之后突然告诉叶云，说她今晚要去学校陪她的好闺蜜，跟她一起睡，明天也不回来了，她们会继续在市里逛逛，要一直到晚上才回，于是叶云果断进入了系统新找到的位面世界，而这个世界的名字叫做《纳米核心》。
这个世界故事是发生在一颗名叫元星的星球上，这颗星球位于银河系的边缘，宇宙坐标nwx185。元星有三颗月星环绕，分别是海拉，徇，以及艾尔西娅。其恒星为“尚”。
元星自文字出现以来的历史分为古典纪，圣战纪，启蒙纪，革新纪，以及琥珀纪。
元星的人类刚开始也是跟地球的人类一样慢慢进化发展，不过在古典纪，这个世界发生了一个巨大的转折点，一艘神秘的宇宙飞船坠落元星，飞船与元星的碰撞中，产生的辐射带以及带来的宇宙射线，造成“紫雾流萤”的现象，飞船的残骸被一颗巨大的“世界树”覆盖。
飞船坠落几百年之后，元星人类在偶然下与飞船进行接触，飞船检测到人类脑电波发出的信号，为人类带来诸多“神迹”。从此，飞船被称为“圣柜”。元星人类对圣柜的崇拜形成了宗教，圣柜坠落地点也成为了元星政治、文化中心，圣战纪自此开始。
这个纪中，元星的人类科技还未足够发达，只是将它当成精神的信仰，就这样懵懵懂懂的又过了几百年，当人类的科技足够发达之后他们开始研究这艘飞船，发现了“以太结晶”的能源使用价值，人类迎来了一个科技爆发的时代，也是这个时代，基因改造人出现。“亚人”这个称呼也由批评家首次提出，并被世人接受，而这个科技爆炸式发展的时代也被称之为启蒙纪。
亚人虽然是被人以科技改造出来的，但他们也是由人类的胚胎细胞发育而成，也一样拥有人类的感情，而且他们还拥有理论上近乎无穷的生命，自然不甘平庸，于是亚人阶层开始走向政治舞台，成为世界新的主宰，并称自己为“阿萨”，自此革新纪到来，而主角就是阿萨中的一员。
琥珀纪，也就是现在这一纪，这一纪的一千一百三十三年，“石英城惨案”发生，石英城底下的以太结晶因为意外发生了剧烈的爆炸，造成了石英城中数十万人丧生，但真相被亚人所掩盖，外界的人的真相，被误传为了亚人“屠城”，随后，“盖洛斯”和“变种人”相继在紫雾流萤里出现，形成事件亦成为人类反抗者与亚人战争的引爆点。
石英城惨案之后，人类第一次公然武装反抗，大量阿萨人在毫无戒备的情况下被屠杀，但紧接着，反应过来的亚人暴力镇压了人类反抗军，并依靠其远超人类社会的科技，建造了移动的城市阿斯嘉特，悬浮在元星轨道外。阿萨人阶层至此基本脱离人类社会，在阿斯嘉特建立了一个完全由阿萨人构成的政治体系。
随着时光的推移，真相被掩盖在时光的长河当中，亚人也跟人类分离成了两个群体，跟两个敌对的国家有点类似，而在战争中，亚人因为人数稀少（每个都是活了百年以上的社会精英）损失不起，开始专注于研究全机械化部队，并取得了长足的发展，不过随着战斗的长时间接触，人类反抗军掌握了机械兵团的弱点。战争进入相持阶段，于是，金宫的长老“加斯”向赫瓦格机关递交了“纳米尖兵”的计划。
“纳米尖兵计划”表面性质为结合了ai系统的有人操作单兵武器系统，只是搭载有模拟“圣柜”的能量提取原件“纳米核心”，使得尖兵更加厉害，但其实真正的计划是培养拥有独立意识的全机械形态兵器。
纳米尖兵分为培植型跟植入型两种，培植型尖兵是从人工受精阶段就开始介入，从第一次细胞分裂开始就进行细胞和基因的改造，整个过程就受到最严格和最精密的控制。随着被改造者的成长，细胞被完全替换成定制的纳米细胞。被改造者本身会成为一个彻头彻尾的纳米生化人。
植入型：
与培植型不同，使用者是被后期“改造”的战士。由于身体的细胞没被完全替换，只是用一种高强度且灵活的纳米细胞来代替宿主本身的皮肤细胞，再利用该细胞的重组形成装甲表面，因此一些功能受到了限制，而且在使用过后，会在亚人自身的细胞留下毒素，需要维护团队进行维护和清理（有别于用于延长亚人寿命的维护）。
纳米尖兵整个计划的负责人是“帕克斯”的学生“赫雅·埃达斯”院士，她在基因工程学的基础上开发出了纳米细胞，纳米细胞除了能够取代人类的生物细胞维持新陈代谢外，还能够在短时间内强化线粒体，进而利用纳米机械人对宿主进行重组成为尖兵。但经过十七年的研究后，真正成功的是ga-17这一个案列，也就是这个故事的主人